什么是本体论 　　一般而言，本体论是一门哲学研究，中文称为本体论或存在论，研究什么样的事物客观存在——即在宇宙中存在着什么实体。本体论这一名字起源希腊语的onto（意为存在）和logia（记载或口述的箴言）。它是形而上学的一个分支，形而上学则是一门研究第一原则或事物本质的学科。 本体论 ...

为了查找某个研究领域的相关信息，生物学家往往要花费大量的时间，更糟糕的是，不同的生物学数据库可能会使用不同的术语，好比是一些方言一样，这让信息查找更加麻烦，尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...

Gene Ontology (GO) 注释 Posted on 2017-06-11 | In 生信 相似的基因在不同物种中，其功能往往保守的。显然，需要一个统一的术语用于描述这些跨物种的同源基因及其基因产物的功能，否则，不同的实验室对相同的基因的功能的描述不同，将极大限制学术 ...

很多网站对基因结构的描述不清晰或不准确，此处给出较为权威的基因结构： ...

　　在进化过程中，新基因通常来自事先存在的基因，新基因的功能从先前基因的功能进化而来。新基因的原材料 来自基因组区域的重复，这种重复可包括一个或多个基因。 　　作为物种形成的伴随事件而被重复，并继续保持相同功能的基因，称为直系同源基因（orthologous gene）。 新的基因功能可由 ...

本体网络（Ontology） 新一代分布式信任链网 在开始了解项目之前，让我们先看一段“第一财经”频道关于“本体网络”的介绍： 项目介绍 1摘要 类型 提供不同分布式应用场景的开放基础模块，构建跨链、跨系统、跨行业、跨应用和跨终端的分布式信任基础设施 ...

本文为入门级的基因调控网络文章，主要介绍一些基本概念及常见的GRN模型。 概念：基因调控网络 (Gene Regulatory Network, GRN)，简称调控网络，指细胞内或一个基因组内基因和基因之间的相互作用关系形成的网络，特指基因调控 (gene regulation) 导致基因 ...

GWAS研究中经常涉及到基因座（locus）的概念，下面简要介绍一下批量注释基因到基因座的方法。 1、单个基因注释到基因座 对于单个基因的基因座注释，比较简单，常用的工具有：UCSC Genome Browser、NCBI。 比如UCSC Genome Browser： 还有NCBI ...