前言 本文主要演示GEO数据库的一些工具，使用的数据是2015年在Nature Communications上发表的文章Regulation of autophagy and the ubiquit ...

GSVA的简介 Gene Set Variation Analysis，被称为基因集变异分析,是一种非参数的无监督分析方法，主要用来评估芯片核转录组的基因集富集结果。主要是通过将基因在不同样品间 ...

　　Gene Expression Omnibus（GEO）是一个公共存储库，可以存档和自由分发由科学界提交的全套微阵列，新一代测序和其他形式的高通量功能基因组数据。 除数据存储外，还提供一系列基于W ...

转录组分析流程(有参和无参de novo) 获得测序数据，Fastq格式，称之为Raw data。 质量检测 比对Mapping Quantification|Qu ...

　　RNA测序（RNA Sequencing，简称RNA-Seq，也被称为全转录物组鸟枪法测序Whole Transcriptome Shotgun Sequencing，简称WTSS），是基于二代测 ...

参考：https://www.cnblogs.com/xiaojikuaipao/p/7190779.html https://blog.csdn.net/ygyxl/article/detail ...

软件介绍 软件安装 R版本 需要安装hdf5，详细见hdf5的安装 然后报错，需要安装pcaMethods 继续安装报错 安装完成 ...

RNA Sequencing Methods Low-Level RNA Detection CEL-Seq ...

软件介绍 SENIC是一种同时重建基因调控网络并从单细胞RNA-seq数据中鉴定stable cell states的工具。基于共表达和DNA模基序 （motif）分析推断基因调控网络 ，然后在每个 ...

DAVID网站提供了id转换的功能 1 选择上传gene list文件 2 选择上传ID的类型，我们ID-list.txt中的是Ensembl Gene ID，所以这里 ...