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SNPEFF snp注释 (添加自己基因组)

之间介绍过annovar进行对snp注释,今天介绍snpEFF SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It an ...

Mon Jun 03 06:02:00 CST 2019 0 1247
snpEff 对snp进行功能注释

主页使用说明http://snpeff.sourceforge.net/SnpEff_manual.html。 下载解压即可使用(java)。 一、建库 (1)已有2500个基因组的库,直接下载 ...

Mon Mar 19 23:43:00 CST 2018 0 1656
annovar 注释除人类以外的SNP

1. 准备文件: ref.fa ref.gtf或者gff3,最好是gtf3,可将gff3转化为gtf sample.vcf 2. 用gff3ToGenePred与gtfToGen ...

Tue Sep 03 20:06:00 CST 2019 0 358

 
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