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如何从NCBI下载基因组数据

本文关于如何在 NCBI 的 FTP 里下载需要的基因组数据。 已知信息 例如:我从文献里看到作者测了 Escherichia coli ATCC 25922 的基因组,想从NCB ...

Fri Nov 24 17:59:00 CST 2017 0 9524
如何到NCBI提交基因组

1 步骤和说明 NCBI官方说明 点此处打开提交基因组页面 以下例子:纯菌的基因组草图用于新菌鉴定。 1.1 提交基因组数据到 NCBI 需要什么? .fsa 格式的基因组数据; ...

Thu Mar 29 22:38:00 CST 2018 0 6181
xgene:肿瘤相关基因 KRAS,,BRAF,,通路PI3K-AKT

KRAS基因 一个是KRAS1,位于chr6 短臂上,是一个“假基因”,它不能被转录成RNA,故没有功能的 另一个是KRAS2,位于chr12 短臂上。。是“真基因”,是能够转录、并且翻译成蛋白的 ...

Tue Sep 12 20:32:00 CST 2017 0 4804
基因注释 InterProScan的三种使用方法

InterProScan的三种使用方法 Interproscan,通过蛋白质结构域和功能位点数据库预测蛋白质功能。是EBI开发的一个集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余数据库。Inter ...

Thu Mar 27 00:06:00 CST 2014 0 9261
Est数据库

Est--编码序列,gene 片段且具有标签 其中,est数据库中是类似测序1、测序2、测序3这样的序列。实验室测得的序列是cDNA,通过上图方法拼接,电脑克隆(dbest)。如果 ...

Wed Nov 20 19:34:00 CST 2019 0 812
怎样在heatmap中使用多种cluster方法

生物信息学中经常使用R 来画图,而R画heatmap的功能是非常强大的。通常,我的习惯是使用gplots包中的heatmap.2函数来进行画图。不过这个函数中不能对聚类分析(clustering)到方 ...

Fri Oct 19 16:22:00 CST 2012 0 5348
Biopython学习笔记

一、Biopython 学习资料 Biopython教程和cookbook: http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html ...

Fri Dec 10 22:00:00 CST 2021 0 1212
xgene:之illumina,,ion-torrent

illumina技术:   工具:flowcell(流动池):8通道,每个通道都有 2种DNA引物 种在玻璃表面(用共价键连到Flowcell上),这引物和文库中的接头互补      Flo ...

Fri Sep 01 20:05:00 CST 2017 0 1654

 
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