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生信基础知识【04】GO和pathway分析

非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能、参与的生物途径及细胞 ...

Fri Jun 22 19:59:00 CST 2018 0 16287
全基因组测序 从头测序(de novo sequencing) 重测序(re-sequencing)

全基因组测序 全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing)。 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序,利用生物信息学分析方法进行拼接、组装,获得该物种的基因组 ...

Fri Oct 19 19:16:00 CST 2018 0 13208
什么是转录因子?

什么是转录因子? 转录因子 转录因子基本介绍 什么是转录因子? 转录因子(Transcriptionfactor,TF)是一个能与特异DNA序列结合的蛋 ...

Fri Oct 19 06:37:00 CST 2018 0 10052
利用MEGA-X选择模型及构建美化进化树

对于经常构建进化树的朋友来说,MEGA应该是个老朋友了。MEGA从1993年的第一个版本问世一直锤炼到去年刚刚发布的MEGA-X,已经经历了26年,在这期间,MEGA共更新八个版本,先后在Molecu ...

Sun Mar 08 12:23:00 CST 2020 0 9120
单细胞测序技术之研究必看8篇经典综述

单细胞测序技术之研究必看8篇经典综述 单细胞生物学最近几年是非常热门的话题。在这一领域中,不得不提Single-cell sequencing单细胞测序技术。使不同细胞类型得以精细区分 ...

Tue Oct 23 03:28:00 CST 2018 0 9583
直系同源基因(orthologous gene)和旁系同源基因(paralogous gene)

  在进化过程中,新基因通常来自事先存在的基因,新基因的功能从先前基因的功能进化而来。新基因的原材料 来自基因组区域的重复,这种重复可包括一个或多个基因。   作为物种形成的伴随事件而被重复,并继 ...

Thu Jul 04 23:36:00 CST 2019 0 5268
【转录组入门】4:参考基因组和注释文件

作业要求: 在UCSC下载hg19参考基因组,我博客有详细说明,从gencode数据库下载基因注释文件,并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构,比如TP53,KRAS,EGFR等等。 作业,截图几个 ...

Sun Jul 01 05:27:00 CST 2018 0 9768
一文搞懂基因融合(gene fusion)的定义、产生机制及鉴定方法

欢迎关注微信公众号:AIPuFuBio和使用生物信息学平台AIPuFu:www.aipufu.com。 【基因融合的定义】 基因融合(gene fusion)是指由于某种机制(如基因组变异)使得两个不同基因的部分序列或全部序列融合到一起,形成了一个新的基因。如下图所示 ...

Tue Oct 01 22:14:00 CST 2019 1 3613

 
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