前面已经讲解了： 单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing 单细胞分析实录(2): 使用Cell Ranger得到表达矩阵 单细胞分析实录(3): Cell Hashing数据拆分 ...

参考资料： 1.医学分子生物学 第六章 第一节 表观遗传学-甲基化 2.医学分子生物学 第六章 第二节 表观遗传学-组蛋白修饰 3.组蛋白修饰是个啥 1.什么是表观遗传学？ 举个例子：同卵双生的双 ...

前面我们已经学习了单细胞转录组分析的：使用Cell Ranger得到表达矩阵和doublet检测，今天我们开始Seurat标准流程的学习。这一部分的内容，网上有很多帖子，基本上都是把Seurat官网P ...

本文为入门级的基因调控网络文章，主要介绍一些基本概念及常见的GRN模型。 概念：基因调控网络 (Gene Regulatory Network, GRN)，简称调控网络，指细胞内或一个基因组内基因和 ...

今天的内容讲讲单细胞文章中经常出现的展示细胞marker的图：tsne/umap图、热图、堆叠小提琴图、气泡图，每个图我都会用两种方法绘制。 使用的数据来自文献：Single-cell tra ...

细胞通讯分析可以给我们一些细胞类群之间相互调控/交流的信息，这种细胞之间的调控主要是通过受配体结合，传递信号来实现的。不同的分化、疾病过程，可能存在特异的细胞通讯关系，因此阐明这些通讯关系至关重要。 ...

一、测序原理 先介绍 Nanopore 测序中的几位主角： Reader ：在自然界中，有一种可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白，具有天然的蛋白纳米孔。经过人为基因工程修饰后，得到的就 ...

上一篇已经讲解了Seurat标准流程，推文的最后，注意到了不同样本之间的表达数据是存在批次效应的，就像下图这样，有些是可以聚到一起的亚群，却出现了不同样本分开/偏移的情况，比如第3群，这种就是批次效应 ...

该选择多少个主成分 群体结构（population structure），或者说群体分层（population stratification），是由于个体之间非随机交配而导致的群体中亚群之间等位基因 ...

资料来源： 细胞、染色体、DNA和基因的关系 细胞核中包含染色体，人体共有23对染色体（22+XY/XX），染色体由DNA组成，DNA是由互补碱基对组成的双螺旋结构，DNA链中只有一部分信息可以编码 ...