全基因组测序 全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing)。 从头测序(de novo)不需要任何参考基 ...

单细胞测序技术(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 来源： 一呼百诺 点击次数：6587关键词： ...

HTSeq作为一款可以处理高通量数据的python包，由Simon Anders, Paul Theodor Pyl, Wolfgang Huber等人携手推出HTSeq — A Python ...

单细胞测序技术之研究必看8篇经典综述 单细胞生物学最近几年是非常热门的话题。在这一领域中，不得不提Single-cell sequencing单细胞测序技术。使不同细胞类型得以精细区分 ...

作业要求： 在UCSC下载hg19参考基因组，我博客有详细说明，从gencode数据库下载基因注释文件，并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构，比如TP53,KRAS,EGFR等等。 作业，截图几个 ...

使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq数据分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, ...

转录组分析工具大比拼 文献阅读与翻译 - Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing ...

RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析 差异分析的步骤：1）比对；2） read count计算；3） read count的归一化；4）差异表达分析； 背景知识：1）比对：普通比对： B ...

Bowtie2的安装与使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用来快速比对短reads(50-100bp)与参考基因 ...

作业要求： 使用R语言，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。 基本任务是得到差异分析结果，进阶任务是比较多个差异 ...