GTEx database:该数据库是健康人贡献的组织的RNASeq的数据。还有snp信息。将snp信息与gene的表达水平结合起来。 donor: donor贡献的tissue。 ...
GTEx database:该数据库是健康人贡献的组织的RNASeq的数据。还有snp信息。将snp信息与gene的表达水平结合起来。 donor: donor贡献的tissue。 ...
gene symbol: TP53 gene ID:7157。Entrez Gene ID,它是目前国际上最权威的Gene ID编号! GENECODE:GENECODE来自Ensembl数 ...
下列所用到的数据均为千人基因组数据库 1、通过vcftools计算FST 命令行如下: 其中,input_data.vcf就是输入的vcf格式 population_1.txt的 ...
首先,进入千人基因组数据库的网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/ 如下图所示,在数据库的框框里输入我们感兴趣的SN ...
1、列表包括数据库名称、表型、是否能下载到基因型(genotype)、是否能下载到GWAS结果文件(P值、效应值、SNP位点)。目前收集到的有如下: 参考到这些数据库的文献:Genome-wid ...
参考资料来源: http://software.broadinstitute.org/gsea/doc/GSEAUserGuideFrame.html https://cloud.tencent. ...
如果转载,请注明出处。 GSEA、David与KEGG、GO数据库的区别: 1.KEGG数据库、GO数据库是知识库。它们记录了通路、生物学过程等的信息。 2.GSEA、David是做富集分 ...
下载vcf文件: 方法一:进入ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/release/20130502/,直接下载相应染色体的vcf 方法二:进入http ...
plink1.9版本支持转化为VCFv4.2格式 plink2.0版本支持转化为VCFv4.3格式 两个版本用到的命令不一样 对于plink1.9版本,转化为vcf文件的命令行为: ...
oracle表空间简介 Oracle表空间是数据管理的基本方法,所有用户的对象要存放在表空间中,也就是用户有空间的使用权,才能创建用户对象。否则是不充许创建对象,因为就是想创建对象,如表,索引等 ...