数据预处理（DNA genotyping、Quality control、Imputation） QC的工作可以做PLINK上完成Imputation的 ...

流行病学研究常见的分析就是相关性分析了。 相关性分析某种程度上可以为我们提供一些研究思路，比如缺乏元素A与某种癌症相关，那么我们可以通过补充元素A来减少患癌率。这个结论的大前提是缺乏元素A会导致这种 ...

全基因组关联分析流程： 一、准备plink文件 1、准备PED文件 PED文件至少有六列，内容如下： Family ID Individual ID Pater ...

Swiss-model也是一款预测蛋白质结构模型的工具。网页地址：https://swissmodel.expasy.org/ 首先，进行常规的注册后，点击start modelling 以搜索B ...

一、什么是多基因风险评分 传统的GWAS研究只计算单个SNP位点与表型之间的关联性，再用Bonferroni校正，通过给定的阈值，筛选出显著的SNP位点。 这样会存在两个问题，第 ...

画曼哈顿图和QQ plot 首推R包“qqman”，简约方便。下面具体介绍以下。 一、画曼哈顿图 install.packages("qqman") library(qqman) ...

如文章“Genome-wide Complex Trait Analysis(GCTA)-全基因组复杂性状分析”中介绍的GCTA，是一款基于全基因组关联分析发展的分析工具，除了计算不同性状/表型间（t ...

新手从零学起，成功跑通，记一下，技术大神们多多指点。 ———————————————— 1-概述 POI：兴趣点。对于百度、高德等电子地图来说，一个POI是地图上的一个店铺/商场/小区等等。 ...

I-TASSER是一款用于预测蛋白质结构和功能的工具，网站链接：https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ 具体描述如下： I-TASSER (It ...

孟德尔随机化(Mendelian Randomization) 统计功效（power）和样本量计算 1 统计功效（power）概念 统计功效（power）指的是在原假设为假的情况下，接受备择假设的 ...