什么是本體論 　　一般而言，本體論是一門哲學研究，中文稱為本體論或存在論，研究什么樣的事物客觀存在——即在宇宙中存在着什么實體。本體論這一名字起源希臘語的onto（意為存在）和logia（記載或口述的箴言）。它是形而上學的一個分支，形而上學則是一門研究第一原則或事物本質的學科。 本體論 ...

為了查找某個研究領域的相關信息，生物學家往往要花費大量的時間，更糟糕的是，不同的生物學數據庫可能會使用不同的術語，好比是一些方言一樣，這讓信息查找更加麻煩，尤其是使得機器查找無章可循。Gene Ontology就是為了解決這種問題而發起的一個項目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...

Gene Ontology (GO) 注釋 Posted on 2017-06-11 | In 生信 相似的基因在不同物種中，其功能往往保守的。顯然，需要一個統一的術語用於描述這些跨物種的同源基因及其基因產物的功能，否則，不同的實驗室對相同的基因的功能的描述不同，將極大限制學術 ...

很多網站對基因結構的描述不清晰或不准確，此處給出較為權威的基因結構： ...

　　在進化過程中，新基因通常來自事先存在的基因，新基因的功能從先前基因的功能進化而來。新基因的原材料 來自基因組區域的重復，這種重復可包括一個或多個基因。 　　作為物種形成的伴隨事件而被重復，並繼續保持相同功能的基因，稱為直系同源基因（orthologous gene）。 新的基因功能可由 ...

本體網絡（Ontology） 新一代分布式信任鏈網 在開始了解項目之前，讓我們先看一段“第一財經”頻道關於“本體網絡”的介紹： 項目介紹 1摘要 類型 提供不同分布式應用場景的開放基礎模塊，構建跨鏈、跨系統、跨行業、跨應用和跨終端的分布式信任基礎設施 ...

本文為入門級的基因調控網絡文章，主要介紹一些基本概念及常見的GRN模型。 概念：基因調控網絡 (Gene Regulatory Network, GRN)，簡稱調控網絡，指細胞內或一個基因組內基因和基因之間的相互作用關系形成的網絡，特指基因調控 (gene regulation) 導致基因 ...

GWAS研究中經常涉及到基因座（locus）的概念，下面簡要介紹一下批量注釋基因到基因座的方法。 1、單個基因注釋到基因座 對於單個基因的基因座注釋，比較簡單，常用的工具有：UCSC Genome Browser、NCBI。 比如UCSC Genome Browser： 還有NCBI ...