全基因組測序 全基因組測序分為從頭測序(de novo sequencing)和重測序(re-sequencing)。 從頭測序(de novo)不需要任何參考基 ...

單細胞測序技術(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 來源： 一呼百諾 點擊次數：6587關鍵詞： ...

HTSeq作為一款可以處理高通量數據的python包，由Simon Anders, Paul Theodor Pyl, Wolfgang Huber等人攜手推出HTSeq — A Python ...

單細胞測序技術之研究必看8篇經典綜述 單細胞生物學最近幾年是非常熱門的話題。在這一領域中，不得不提Single-cell sequencing單細胞測序技術。使不同細胞類型得以精細區分 ...

作業要求： 在UCSC下載hg19參考基因組，我博客有詳細說明，從gencode數據庫下載基因注釋文件，並且用IGV去查看你感興趣的基因的結構，比如TP53,KRAS,EGFR等等。 作業，截圖幾個 ...

使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq數據分析易如反掌 Charity Law1, Monther Alhamdoosh2, Shian Su3, Xueyi Dong3, ...

轉錄組分析工具大比拼 文獻閱讀與翻譯 - Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing ...

RNA-seq中的基因表達量計算和表達差異分析 差異分析的步驟：1）比對；2） read count計算；3） read count的歸一化；4）差異表達分析； 背景知識：1）比對：普通比對： B ...

Bowtie2的安裝與使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用來快速比對短reads(50-100bp)與參考基因 ...

作業要求： 使用R語言，載入表達矩陣，然后設置好分組信息，統一用DEseq2進行差異分析，當然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。 基本任務是得到差異分析結果，進階任務是比較多個差異 ...