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如何從NCBI下載基因組數據

本文關於如何在 NCBI 的 FTP 里下載需要的基因組數據。 已知信息 例如:我從文獻里看到作者測了 Escherichia coli ATCC 25922 的基因組,想從NCB ...

Fri Nov 24 17:59:00 CST 2017 0 9524
如何到NCBI提交基因組

1 步驟和說明 NCBI官方說明 點此處打開提交基因組頁面 以下例子:純菌的基因組草圖用於新菌鑒定。 1.1 提交基因組數據到 NCBI 需要什么? .fsa 格式的基因組數據; ...

Thu Mar 29 22:38:00 CST 2018 0 6181
xgene:腫瘤相關基因 KRAS,,BRAF,,通路PI3K-AKT

KRAS基因 一個是KRAS1,位於chr6 短臂上,是一個“假基因”,它不能被轉錄成RNA,故沒有功能的 另一個是KRAS2,位於chr12 短臂上。。是“真基因”,是能夠轉錄、並且翻譯成蛋白的 ...

Tue Sep 12 20:32:00 CST 2017 0 4804
基因注釋 InterProScan的三種使用方法

InterProScan的三種使用方法 Interproscan,通過蛋白質結構域和功能位點數據庫預測蛋白質功能。是EBI開發的一個集成了蛋白質家族、結構域和功能位點的非冗余數據庫。Inter ...

Thu Mar 27 00:06:00 CST 2014 0 9261
Est數據庫

Est--編碼序列,gene 片段且具有標簽 其中,est數據庫中是類似測序1、測序2、測序3這樣的序列。實驗室測得的序列是cDNA,通過上圖方法拼接,電腦克隆(dbest)。如果 ...

Wed Nov 20 19:34:00 CST 2019 0 812
怎樣在heatmap中使用多種cluster方法

生物信息學中經常使用R 來畫圖,而R畫heatmap的功能是非常強大的。通常,我的習慣是使用gplots包中的heatmap.2函數來進行畫圖。不過這個函數中不能對聚類分析(clustering)到方 ...

Fri Oct 19 16:22:00 CST 2012 0 5348
Biopython學習筆記

一、Biopython 學習資料 Biopython教程和cookbook: http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html ...

Fri Dec 10 22:00:00 CST 2021 0 1212
xgene:之illumina,,ion-torrent

illumina技術:   工具:flowcell(流動池):8通道,每個通道都有 2種DNA引物 種在玻璃表面(用共價鍵連到Flowcell上),這引物和文庫中的接頭互補      Flo ...

Fri Sep 01 20:05:00 CST 2017 0 1654

 
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