【生物信息】RPKM, FPKM和TPM

注：這幾個名詞是RNA-Seq數據分析中的基礎，在此小結一下。 在RNA-Seq的分析中，對基因或轉錄本的read counts數目進行標准化（normalization）是一個極其重要的步驟 ...

【bioinfo】生物信息學——代碼遇見生物學的地方

注：從進入生信領域到現在，已經過去快8年了。生物信息學包含了我最喜歡的三門學科：生物學、計算機科學和數學。但是如果突然問起，什么是生物信息學，我還是無法給出一個讓自己滿意的答案。於是便有了這篇博客。 ...

從序列查找下載（NCBI）處理到多序列比對----記錄一次不太成功的嘗試

一、問題呈現 找到Streptomyces屬里hrdb基因的啟動子（hrdbp）的保守序列，希望以此推斷出-10區和-35區。 二、過程 1、下載15-20條hrdb基因的啟動子序列，並處理形成 ...