數據預處理（DNA genotyping、Quality control、Imputation） QC的工作可以做PLINK上完成Imputation的 ...

流行病學研究常見的分析就是相關性分析了。 相關性分析某種程度上可以為我們提供一些研究思路，比如缺乏元素A與某種癌症相關，那么我們可以通過補充元素A來減少患癌率。這個結論的大前提是缺乏元素A會導致這種 ...

全基因組關聯分析流程： 一、准備plink文件 1、准備PED文件 PED文件至少有六列，內容如下： Family ID Individual ID Pater ...

Swiss-model也是一款預測蛋白質結構模型的工具。網頁地址：https://swissmodel.expasy.org/ 首先，進行常規的注冊后，點擊start modelling 以搜索B ...

一、什么是多基因風險評分 傳統的GWAS研究只計算單個SNP位點與表型之間的關聯性，再用Bonferroni校正，通過給定的閾值，篩選出顯著的SNP位點。 這樣會存在兩個問題，第 ...

畫曼哈頓圖和QQ plot 首推R包“qqman”，簡約方便。下面具體介紹以下。 一、畫曼哈頓圖 install.packages("qqman") library(qqman) ...

如文章“Genome-wide Complex Trait Analysis(GCTA)-全基因組復雜性狀分析”中介紹的GCTA，是一款基於全基因組關聯分析發展的分析工具，除了計算不同性狀/表型間（t ...

新手從零學起，成功跑通，記一下，技術大神們多多指點。 ———————————————— 1-概述 POI：興趣點。對於百度、高德等電子地圖來說，一個POI是地圖上的一個店鋪/商場/小區等等。 ...

I-TASSER是一款用於預測蛋白質結構和功能的工具，網站鏈接：https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ 具體描述如下： I-TASSER (It ...

孟德爾隨機化(Mendelian Randomization) 統計功效（power）和樣本量計算 1 統計功效（power）概念 統計功效（power）指的是在原假設為假的情況下，接受備擇假設的 ...