原文:PYMOL分子比对

两种方式: 一,分子全局比对 导入第一个分子 导入第二个分子 选中第一个分子 A align to molecule 选中第二个分子 此时,会出现较多黄黄的线,难看死了 我猜全局比对只适合高度同源的分子 二,分子局部比对 导入第一个分子 导入第二个分子 选择第一个分子的比对氨基酸序列,并重新命名A 选择第二个分子的比对氨基酸序列,并重新命名B 第一个分子的部分氨基酸序列对象A A align to ...

2022-03-22 01:01 0 760 推荐指数:

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pymol安装

今天安装一天的pymol,其实问题就在于自己python版本用得太高了。一定要匹配。 安装教程来源于知乎 要提前具有Anaconda、python3.6和对应3.6的pymol-win-cp36.whl 中间用windowspower shell来运行。 以后还是想在linux上做东 ...

Mon Jul 13 05:12:00 CST 2020 0 695
分子对接

分子对接是通过受体的特征以及受体和药物分子之间的相互作用方式来进行药物设计的方法。主要研究分子间(如配体和受体)相互作用,并预测其结合模式和亲合力的一种理论模拟方法.近年来,分子对接方法已成为计算机辅助药物研究领域的一项重要技术。 分子对接方法 分子对接方法的两大课题是分子之间的空间 ...

Sun Mar 14 18:20:00 CST 2021 0 982
分子对接

分子对接(molecular docking):计算机模拟分子间的识别过程,预测结合方式,通过结合方式信息可以用打分函数来预测两个分子的结合强弱(亲和力) 本质:两个或多个分子之间的识别过程,其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。 应用:分子对接方法在药物设计、材料设计等领域广泛应用 ...

Tue Nov 09 03:44:00 CST 2021 0 129
分子伴侣

分子伴侣(Chaperone),又称为侣伴蛋白(molecular chaperone)。英文单词原意是指姆,即负责监管、教育年轻未婚少女的行为的老年妇女。是一类协助细胞内分子组装和协助蛋白质折叠的蛋白质。包括热休克蛋白Hsp60和Hsp70两个家族。另外,使用ATP协助蛋白质折叠 ...

Sun Aug 30 08:23:00 CST 2020 0 534
Pymol里常用到的命令,随用随记

python脚本运行方式: 1, File->Run Script->选择python脚本; 2, run python脚本 常用命令: load *.pdb remove so ...

Wed Jun 10 00:04:00 CST 2020 0 947
多序列比对

文章转载于 Original 2017-07-11 liuhui 生信百科 多序列比对(或多序列联配,multiple sequence alignment,MSA),是指把多条(3 条或以上)有系统进化关系的蛋白质或核酸序列进行比对,尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一 ...

Sun Jul 16 05:43:00 CST 2017 0 1903
为什么要划分子网?

IPv4地址如果只使用有类(A、B、C类)来划分,会造成大量的浪费或者不够用,为了解决这个问题,可以在有类网络的基础上,通过对IP地址的主机号进行再划分,把一部分划入网络号,就能划分各种类型大小的网络 ...

Fri Nov 29 07:24:00 CST 2019 0 412
如何划分子

子网掩码用于辨别IP地址中哪部分为网络地址,哪部分为主机地址。全长为32位,由0和1构成。为1的表示网络位,为0的表示主机位。对于默认的A、B、C三大类的子网掩码默认是: A类:255.0.0.0 B类:255.255.0.0 C类:255.255.255.0 一般对于划分子 ...

Thu Oct 18 18:15:00 CST 2018 1 2507
 
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