Gromacs分子动力学模拟主要可以分为以下几个步骤，不同的体系步骤可能略有不同。 在开始之前，先简单了解一下预平衡： 分子动力学模拟的最终目的是对体系进行抽样，然后计算体系的能量，各种化学键，成 ...

Martini粗粒化模型一开始就是为脂质开发的.（http://jerkwin.github.io/2016/11/03/Martini%E5%AE%9E%E4%BE%8B%E6%95%99%E7%A ...

mdp文件是能量最小化，NVT模拟，NPT模拟与MD模拟的必须文件。 mdp文件的详细解释可以参考官方文档http://manual.gromacs.org/online/mdp_opt.html ...

1，下载安装新版本的gcc（高版本的gcc只是推荐使用的，系统自带的gcc4.4照样能正常编译、运行） 安装完成后设置环境变量(/etc/profile)，需要重新登录后才起作用。 ...