FastQC 的安裝
安裝 FastQC FastQC 下載 解壓 設置權限 加入到 PATH 測試 應該能看到幫助信息，說明已經安裝成功 ...
原文：FastQC
下載fastqc wget http: www.bioinformatics.babraham.ac.uk projects fastqc fastqc v . . .zip 解壓 unzip fastqc v . . .zip 給予執行權限，否則執行的時候會顯示沒有權限 cd FastQC chmod fastqc 加入到PATH export PATH home h FastQC : PAT ...
2017-08-03 10:53 0 2215 推薦指數：
相關推薦
FastQC結果詳解
REF https://www.plob.org/article/5987.html 解壓后，查看html格式的結果報告。結果分為如下幾項： 結果分為綠色的"PASS"，黃色的"WARN"和 ...
Fastqc使用說明
用FastQC檢查二代測序原始數據的質量 2013-01-28 21:28:10| 分類： Bioinformatics | 標簽：bioinformatics deep-seq |舉報 |字號大中小 訂閱 ...
fastqc出現錯誤
先用conda安裝 很順利 輸入 結果 可是輸入 這個網上說沒有圖形界面 可以這樣 或者 都可以 ...
FastQC及MultiQC整合使用
FastQC FastQC 是一個基於Java寫的測序數據質量評估軟件。因為是用跨平台的語言Java寫的，自然而然FastQC應是可以在不同系統運行的了。不過也許大多時候我們還是在Linux服務器上用的多吧。 安裝 安裝軟件，方便的還是通過conda了，一行命令： 當然這需要你已經安裝 ...
FastQC 測序質量
文章轉載於 Original 2017-07-06 Jolvii 生信百科 介紹一下如何理解 FastQC 各模塊的結果 FastQC 的使用 FastQC的安裝介紹請看這里。FastQC 支持 fastq、gzip 壓縮的 fastq、SAM、BAM 等格式，在不指定文件 ...
Linux 安裝運行Fastqc
1.從官網下載FastQC https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 2.解壓文件，並進入該文件 將其至於某個文件夾，unzip fastqc_v0.11.5.zip. 3.進入解壓目錄，設置可執行權限 ...
測序數據質控-FastQC
通常我們下機得到的數據是raw reads，但是公司通常會質控一份給我們，所以到很多人手上就是clean data了。我們再次使用fastqc來進行測序數據質量查看以及結果分析。 fastqc的操作： 1. FastQC使用 fastqc -f [bam | sam | fastq ...