Linux 安裝運行Fastqc


1.從官網下載FastQC

https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/

2.解壓文件,並進入該文件

將其至於某個文件夾,unzip fastqc_v0.11.5.zip.

3.進入解壓目錄,設置可執行權限

chmod u+x fastqc #chmod 754 fastqc

4.配置環境變量

vim ~/.bashrc

export PATH=$PATH:/home/zhou/bio_solfware/FastQC/ # 添加至文件最后一行,注意這個是整個文件夾

source ~/.bashrc #使配置文件生效

5. 下載Java

5.1 下載Java, sudo apt install openjdk-8-jdk

5.2 查看Java是否安裝成功 Java -version.

6. 常見Fastqc命名

fastqc -t 8 x.fastq -o ./test

 

 
         
 

 


免責聲明!

本站轉載的文章為個人學習借鑒使用,本站對版權不負任何法律責任。如果侵犯了您的隱私權益,請聯系本站郵箱yoyou2525@163.com刪除。



 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM