1.從官網下載FastQC
https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/
2.解壓文件,並進入該文件
將其至於某個文件夾,unzip fastqc_v0.11.5.zip.
3.進入解壓目錄,設置可執行權限
chmod u+x fastqc #chmod 754 fastqc
4.配置環境變量
vim ~/.bashrc
export PATH=$PATH:/home/zhou/bio_solfware/FastQC/
# 添加至文件最后一行,注意這個是整個文件夾
source
~/.bashrc
#使配置文件生效
5. 下載Java
5.1 下載Java, sudo apt install openjdk-8-jdk
5.2 查看Java是否安裝成功 Java -version.
6. 常見Fastqc命名
fastqc -t 8 x.fastq -o ./test