1.从官网下载FastQC
https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/
2.解压文件,并进入该文件
将其至于某个文件夹,unzip fastqc_v0.11.5.zip.
3.进入解压目录,设置可执行权限
chmod u+x fastqc #chmod 754 fastqc
4.配置环境变量
vim ~/.bashrc
export PATH=$PATH:/home/zhou/bio_solfware/FastQC/
# 添加至文件最后一行,注意这个是整个文件夹
source
~/.bashrc
#使配置文件生效
5. 下载Java
5.1 下载Java, sudo apt install openjdk-8-jdk
5.2 查看Java是否安装成功 Java -version.
6. 常见Fastqc命名
fastqc -t 8 x.fastq -o ./test