KEGG Pathway Anonatation
转载于 Original 2017-06-20 liuhui 生信百科 KEGG 数据库中，把功能相似的蛋白质归为同一组，然后标上 KO 号。通过相似性比对，可以为未知功能的蛋白序列注释上 KO 号。通过KEGG数据库的注释极大的方便我们进行生物学通路的研究，可以直接查看物种某条生物学通路 ...
原文：KEGG PATHWAY
KEGG PATHWAY Database KEGG PATHWAY 数据库是一个手工画的代谢通路的集合，包含以下几方面的分子间相互作用和反应网络： .新陈代谢 .遗传信息加工 .环境信息加工 .细胞过程 .生物体系统 .人类疾病 .药物开发 PATHWAY的五种类型 仅仅第一种参考通路 reference pathway 图是手动画出来的，其他的通路图都是通过计算产生的。pathway中的每一 ...
2020-03-15 21:58 0 777 推荐指数：
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KEGG mapper： 输入：cufdiff生成的差异基因列表（log2fold_change的绝对值>1, pvalue<0.01） 目的：在KEGG网站中，利用KEGG mapper工具进行pathway注释。 过程： 1. ID转换：将gene symbol转换 ...
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KEGG注释
在 KEGG 数据库中，把功能相似的蛋白质归为同一组，然后标上 KO 号。通过相似性比对，可以为未知功能的蛋白序列注释上 KO 号。 截止到 2015 年 6 月 12 日，KEGG 数据库中共收录了 3,904 个完整的基因组。其中 304 个为真核生物，3,600 个为原核生物。在真 ...
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