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bioMart进行基因id的转换

1.bioMart包的介绍 bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口,能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库,这个包可以做以下几个工作: 1.查找某个基因在染色体 ...

Tue Dec 17 23:40:00 CST 2019 0 9191
网页工具KOBAS进行KEGG富集分析

KOBAS的介绍 KOBAS是北大生物信息中心研发的一个网页工具,用来基因/蛋白功能注释(注释模块)和功能基因集富集(富集模块)。以下是KOBAS的英文介绍: KOBAS 3.0 is a web ...

Sat Jan 04 21:32:00 CST 2020 0 5837
GO分析-GOseq的使用教程

GOseq的介绍 GOseq是一个R包,用于寻找GO terms,即基因富集分析。此方法基于 Wallenius non-central hyper-geometric distribution。相 ...

Tue Dec 31 06:11:00 CST 2019 0 2892
edgeR之配对检验分析差异基因的使用教程

edgeR的介绍 背景 RNA-seq表达谱与生物复制的差异表达分析。 实现一系列基于负二项分布的统计方法,包括经验贝叶斯估计,精确检验,广义线性模型和准似然检验。 与RNA-seq一样,它可用于 ...

Wed Dec 18 21:50:00 CST 2019 0 803
liftover-基因坐标的转换

liftover的介绍 人类基因组有不同的版本,目前用的最多的是hg38和hg19,为了将不同版本的染色体上的位置一一对应,UCSC出了这款工具liftOver,官方的定义是: This tool ...

Wed Dec 11 05:51:00 CST 2019 0 361

 
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