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完整转录组分析(整理)

转载来自https://zhuanlan.zhihu.com/p/393674599 写的非常好 怕找不到留着自己看!如果作者不同意我会删除。 前言 接下来我们要介绍的是 RNA-seq 数据的 ...

Thu Nov 18 07:05:00 CST 2021 0 7025
QIIME2使用方法

1、数据准备 现在我们常用的就是这种格式的数据,每个样品一对数据文件 数据来源:https://docs.qiime2.org/2019.7/tutorials/importing/ ...

Mon Jun 17 06:53:00 CST 2019 0 2728
CentOS 6.8上安装指定版本的注释软件 VEP,release 93.4

按照同事的要求,安装 v93.4 1、软件下载,gitlab中下载软件一定是到 release中找指定的版本下载,不能直接下载master中的版本,因为master中是开发版本,可能不稳定,只有ma ...

Sat Jun 20 19:50:00 CST 2020 0 923
mafft+phylosuite+raxml

构建系统发育树 有参考《Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution》 最后决定用m ...

Tue Nov 30 06:05:00 CST 2021 0 1142
CentOS 7 上CNVnator安装

1、到github上下载最新版本 https://github.com/abyzovlab/CNVnator/releases 2、先看INSTALL文件,要求以下依赖,我的机器上已经安装了前 ...

Thu Aug 22 23:46:00 CST 2019 0 472
Fst指数说明

群体遗传学--Fst指数,即群体间分化指数,用于群体间分化分析。 群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种,最常用的就是Fst指数。Fst指数,由F统计量演变而来。F统计量(FIS, ...

Fri Mar 22 17:35:00 CST 2019 0 670
rsem对转录本进行定量

最近在研究转录本,现在在下载数据,想起来自己有一个博客,就暂且来这里更新一下内容。 要想对转录本进行定量,首先需要下载它的转录组数据,将别人上传的SRR文件的名字整理在wheat.txt中,引用 ...

Mon Nov 15 04:48:00 CST 2021 0 808

 
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