这个包依赖极有可能是这个:https://www.kegg.jp/kegg/docs/keggapi.html ,如果可以看懂会很好理解 由于KEGG数据库分享数据的策略改变,因此KEGG.db包不 ...
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1)安装载入 ------------------------------------------- if("org.Hs.eg.db" %in% rownames(installed.packa ...
1)简介 edgeR作用对象是count文件,rows 代表基因,行代表文库,count代表的是比对到每个基因的reads数目。它主要关注的是差异表达分析,而不是定量基因表达水平。 edgeR w ...
1)介绍 我们用SRAdb library来对SRA数据进行处理。 SRAdb 可以更方便更快的接入 metadata associated with submission, 包括study, s ...
1)airway简介 在该workflow中,所用的数据集来自RNA-seq,气道平滑肌细胞(airway smooth muscle cells )用氟美松(糖皮质激素,抗炎药)处理。例如,哮喘 ...
前面我们讲过GO.db这个包,现在接着延伸topGO包,该包是用来协助GO富集分析 1)安装 if("topGO" %in% rownames(installed.packages()) = ...