多組學分析及可視化R包
最近打算開始寫一個多組學（包括宏基因組/16S/轉錄組/蛋白組/代謝組）關聯分析的R包，避免重復造輪子，在開始之前隨便在網上調研了下目前已有的R包工具，部分羅列如下： 1. mixOmics 應該是在多組學領域知名度最高的一個R包，有專門的團隊，做了十余年了，引用量也比較高。 官網：http ...
原文：MetaboAnalyst的多組學分析
MetaboAnalyst是做代謝的R包，功能十分強大。也開發了web版本，代謝組學的分析這里不介紹，主要講講它開發的多組學分析的相關內容。 既然是做代謝的工具，即使是增加了多組學內容，肯定也是以代謝為核心。以代謝組為中心的多組學分析想想無非就是以下幾點：多元變量統計分析 網絡分析 pathway分析以及mGWAS或宏組學等，這個工具就有網絡分析和pathway分析。下面我們一起來試試。 網絡分析 ...
2019-11-22 09:56 0 2491 推薦指數：
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