代謝組學分析

本文轉載自查看原文 2021-06-07 16:34 993

綜述文章

【代謝組學】3.數據分析
https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12116920.html

【代謝組學】4.生物標志物分析
https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/12142441.html

非靶向代謝組學數據分析方法總結
https://blog.csdn.net/fjsd155/article/details/89685075

標准數據

流程樣例 & 實用工具

質譜原始數據出發，進行峰對齊、保留時間校正和峰面積提取。代謝物結構鑒定采用精確質量數匹配（<25 ppm）和二級譜圖匹配的方式，檢索METLIN數據庫和 HMDB 數據庫；兩組比較時，刪除兩組組內缺失值均>50%的離子峰；接着對數據進行歸一化（采用 autoscaling或UV法）。百泰派克應用 MetaboAnalysis、SIMCA-P軟件進行多維統計分析和單維統計分析，包括PCA、PLS-DA、OPLS-DA、以及通路富集分析，確保提供全面精准的代謝組學分析結果。