目的 和轉錄組或蛋白組的分析原理類似,目的是: 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路,方便解釋科學問題; 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物學原理/過程。 富集分析方法 富集分析的本質:某個代謝通路在不同的狀態下(如疾病與健康)是否發生了顯著變化? ORA富集 回答的問題 ...
綜述文章 標准數據 流程樣例 amp 實用工具 MetaboAnalyst的多組學分析 代謝組學數據質量評估 主成分分析 PCA PLS DA OPLS DA二維圖 數據歸一化分析 單變量統計分析 差異代謝產物聚類分析 KEGG差異代謝產物通路分析 程序 綜述文章 代謝組學 .數據分析 https: www.cnblogs.com jessepeng p .html 代謝組學 .生物標志物分析 ...
2021-06-07 16:34 0 993 推薦指數:
目的 和轉錄組或蛋白組的分析原理類似,目的是: 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路,方便解釋科學問題; 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物學原理/過程。 富集分析方法 富集分析的本質:某個代謝通路在不同的狀態下(如疾病與健康)是否發生了顯著變化? ORA富集 回答的問題 ...
目錄 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和轉錄組或蛋白組的分析原理類似,目的是: 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路,方便解釋科學問題; 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物學原理 ...
(4)功能層面挖掘 1.實驗及質控 (1)項目流程 代謝組學分析的特點: ...
://github.com/chentianlu 另外,想要代謝入門的同學可讀讀她寫的代謝組學數據分析綜述 ...
概念 生物標志物,即傳說中的biomarker,是一類可測量的,用來表征疾病狀態的物質,通常用於表征: 疾病的狀態(是否為某種疾病/某種亞型); 葯物敏感性,用於用葯指導; 生理狀態 ...
目錄 非靶向代謝組實驗設計 數據分析流程 1.數據預處理 2.數據質控 3.統計分析 非靶向代謝組實驗設計 1.代謝物提取,一般要求每組至少10個樣; 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC; 3.QC樣本與實驗 ...
目錄 概念 類型 效果評價 多變量ROC分析 驗證 分析工具 概念 生物標志物,即傳說中的biomarker,是一類可測量的,用來表征疾病狀態的物質,通常用於表征: 疾病的狀態(是否為某種疾病/某種亞型); 葯物敏感性,用於用葯 ...
非靶向代謝組實驗設計 1.代謝物提取,一般要求每組至少10個樣; 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC; 3.QC樣本與實驗樣本穿插上機,開始十個QC,結尾三個QC,中間每十個樣本穿插一個QC樣本 。 得到質譜譜圖數據經軟件處理后得到峰表。 峰表格式一般為:每行為一個m/z,每列為一個樣 ...