功能內聚：完成一個單一功能，各個部分協同工作，缺一不可。 順序內聚：處理元素相關，而且必須順序執行。 通信內聚：所有處理元素集中在一個數據結構的區域上。 過程內聚：處理元素相關，而且必須按特定的次序執行。 瞬時內聚：所包含的任務必須在同一時間間隔內執行（如初始化模塊）。 邏輯 ...

shannon菌群多樣性指數 H=－∑（Pi）（㏑Pi） Pi=樣品中屬於第i種的個體的比例，如樣品總個體數為N，第i種個體數為ni，則Pi=ni/N； 各種之間，個體分配越均勻，H值就越大。如 ...

# 下載最新版QIIME 2 docker pull qiime2/core:2017.7 # 測試是否安裝成功 docker run -t -i -v $(pwd):/mnt/hgfs/2017 qiime2/core:2017.7 ...

1、數據准備 現在我們常用的就是這種格式的數據，每個樣品一對數據文件 數據來源：https://docs.qiime2.org/2019.7/tutorials/importing/ 2、將數據轉換為qza格式（qiime新定義的自己的格式類型，有點編程中對象的含義 ...

簡單理解一下內聚和耦合。 什么是模塊 模塊就是從邏輯上將系統分解為更細微的部分，分而治之。 復雜問題因為復雜性的問題，比較難解決，但是可以將復雜問題拆解為若干簡單問題，逐個擊破地解決這些簡單問題，最后實現解決復雜問題的效果。 模塊的粒度划分可大可小，可以是函數，類或功能塊等等。 耦合主要 ...

模塊獨立性： 　　指每個模塊只完成系統要求的獨立子功能，並且與其他模塊的聯系最少且接口簡單。 　　兩個定性的度量標准――耦合性和內聚性。 耦合性也稱塊間聯系。 ...

模塊 模塊是由一組語句組成，並且被標識符組成的邊界元素所界定。類，方法都是可以稱之為一個模塊。 內聚與耦合 內聚是指一個模塊內的交互程度，耦合是指模塊間的交互程度。我們需要盡力做到高內聚低耦合。 內聚： 內聚分為如下幾類 ...

對樣品OUT抽平是為了讓各樣品的序列數保持一致,便於在同一標准上對各樣品進行Alpha多樣性分析等,保證有可比性。 Diversity parameters were estimated from OTU and functional gene matrices that were ...