類似篇:轉錄因子motif TSS區域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一個新的領域,現在我關注的是可變剪切調控因子,如PTBP1,它們有特定的RNA結合motif,類似TF。 相同點: 都是蛋白質的序列結合區域 ...
什么是基因的可變剪切 有些基因的前體mRNA pre mRNA 通過不同的剪接方式 選擇不同的剪接位點 產生不同的mRNA剪接異構體,這一過程稱為可變剪接 或者選擇性剪切 Alternative Splicing 。 常見的可變剪切可以分成 類: 外顯子跳躍 Exon Skipping 內含子保留 Intron Retention 端可變剪接 Alternative splice Site 端可 ...
2015-12-27 11:04 0 12226 推薦指數:
類似篇:轉錄因子motif TSS區域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一個新的領域,現在我關注的是可變剪切調控因子,如PTBP1,它們有特定的RNA結合motif,類似TF。 相同點: 都是蛋白質的序列結合區域 ...
SUPPA是一款通過轉錄本定量來獲取可變剪切定量結果的軟件。轉錄本的定量方式有很多,例如count,FPKM, TPM等,作者建議使用TPM,因為先均一化了基因的長度,然后均一化了測序的深度。同時建議使用salmon軟件進行定量 軟件的下載與安裝 首先下載salmon ...
suppa2繼續測試,這個軟件真的非常好用,速度很快、文檔清晰、使用方便。 suppa核心文件: https://github.com/comprna/SUPPA ~/reference ...
可變剪切的預測已經很流行了,目前主要有兩個流派: 用DNA序列以及variant來預測可變剪切;GeneSplicer、MaxEntScan、dbscSNV、S-CAP、MMSplice、clinVar、spliceAI 用RNA來預測可變剪切;MISO、rMATS、DARTS ...
前言:我們知道String類的修飾符是final,其char[] value也是由final修飾的,每次給String變量賦一個新值,都會創建一個新的String對象,很多有涉及到字符串本身的改變都是伴有(new String)的字樣,所以我們說String類是不可變類。但StringBuffer ...
可變與不可變類型 1、可變與不可變類型 1)學python,一定要記住“一切皆為對象,一切皆為對象的引用”; 2)所謂可變對象是指,對象的內容可變,而不可變對象是指對象內容不可變 ...
如何剪切視頻呢?剪切視頻的方法有很多種,別急,今天小編給大家整理了使用VideoProc for Mac全能影片處理工具對視頻進行剪切的教程,感興趣的朋友快來跟小編看看吧! 使用VideoProc for Mac全能影片處理工具對視頻進行剪切的教程: 1.打開 VideoProc 並單擊 ...
做RNA-seq的數據分析,一直弄不清楚實驗過程,最近有時間就找一些資料來了解一下,同時將整理的資料記錄下來,方便以后查找。 來源資料:【3D演示】基因的表達(原版+字幕版) 人體從食物中獲取營養的過程也就是化學消化過程,是通過酶對食物進行分解來得到營養物質。DNA用來制造酶和各種蛋白質。DNA ...