- 什么是基因的可變剪切？
有些基因的前體mRNA（pre-mRNA）通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點）產生不同的mRNA剪接異構體，這一過程稱為可變剪接（或者選擇性剪切）（Alternative Splicing）。
- 常見的可變剪切可以分成6類：
1、外顯子跳躍（Exon Skipping）
2、內含子保留（Intron Retention）
3、5'端可變剪接（Alternative 5' splice Site）
4、3'端可變剪接（Alternative 3' splice Site）
5、最后一個外顯子可變剪接（Alternative Last Exon）
6、第一個外顯子可變剪接（Alternative First Exon）
- 可變剪切的意義
可變剪切是調節基因表達和產生蛋白組多樣性的重要原因，是導致真核生物基因與蛋白質數量差異效果的主要原因。
- 可變剪切預測軟件
使用Cufflinks軟件，與基因原有的剪接模型進行比較，對Mapped Data中的跨內含子Reads，進行新可變剪接事件（Alternative Splicing Events）預測。（Cufflinks測評： Transcript assembly and quantification by RNA Seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation）
使用SpliceGrapher軟件對預測到新的可變剪接事件的基因做模式圖