在研究兩對基因的雜交的時候，往往會遇到不完全遵循孟德爾遺傳分離比的情況，甚至有極其明顯的差距。因此，我們在解答問題或研究時應該注意連鎖現象。
1.連鎖
在此我們以玉米為例作為研究對象研究。
why？：1）可觀察性狀較多。2）同一株有較多種子，便於計數分析。3）雌雄蕊生長花序不同，去雄容易，雜交方便。
在此觀察下列相對性狀的遺傳情況：
1）糊粉層有色對糊粉層無色完全顯性（C，c）
2）飽滿對凹陷完全顯現（Sh，sh）
設若兩對基因獨立分配，將有色飽滿粒植株與無色凹陷粒植株雜交，得到子一代。子一代可得四種配子：CSh，Csh，cSh，csh（假設成立時比例相等）。
將得到的子一代測交，得到測交一代，通過觀察測交一代的性狀表現，可知子一代的配子比例，即可知兩對基因是否獨立分配。
理論結果為： CcShsh：Ccshsh：ccShsh：ccshsh=1:1:1:1
實際結果為：
親組合占比遠遠大於重組合。
若換一種交配方式，即將無色飽滿粒植株與有色凹陷粒植株雜交，得實際結果為：
不論如何，親組合占比都遠遠大於重組合。
可知，存在連鎖現象。
重組率=重組組合/（親組合+重組合）×100%
三點試驗。。。。（待續，未寫完）