關於基因GO分析的DAVID簡單使用


 

利用DAVID簡單的進行GO富集度分析(這里只做簡單的分析,即看基因是否存在在GO的三個過程里面)

比如我們有一組要分析的基因:TRPV6    CXADR    PROM1    GRAMD2    SOX10    GPRIN2    VANGL2    GRHL1    BCL11A    MROH8(這里用的是關於人的基因名)

首先打開DAVID網頁,選擇Functional Annotation:

在左邊的框里面按提示輸入,步驟1,輸入你的ID號,這里可以是基因ID,也可以是基因名,或者是其它的,但是如果你是基因名,則在步驟2選擇GENE SYMBOL

 

選好后,點提交:

點擊確定,就出現下面:

 

選擇人類的類型(Homo sapiens),點擊select Species:

點擊右邊的Gene_Ontology,在GO的三大類中,可以看出在BP中,我們提交的10個基因中有7個在BP中對應有GO Term項。同理還有CC,MF的也可以看出。

本人還在學習當中,如有不對請指出。

 


免責聲明!

本站轉載的文章為個人學習借鑒使用,本站對版權不負任何法律責任。如果侵犯了您的隱私權益,請聯系本站郵箱yoyou2525@163.com刪除。



 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM