原文:转录调控 | Transcriptional Regulation | Regulon

scRNA seq做完该做的QC normalization imputation clustering trajectory和integration,就会开始做转录调控的分析了。 核心就是围绕着TF转录因子做文章 预测TF的靶基因 鉴定regulon 大部分都是高通量的预测,准确性有待论证,需要很好的实验验证设计。 预测的工具不要太多: MARINa Andrea Califano paper ...

2018-05-05 00:04 0 2580 推荐指数:

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转录调控实战 | 一文解决转录调控问题 | chIP-seq | ATAC-seq

做生物的想发文章怎么办?转录调控来解析(huyou)! 最简单的情形: 1. 我在研究一个非常重要的基因A,功能已经做得差不多了,现在想深挖,第一步就是想知道哪个转录因子调控这个基因A; 2. 我发现了一个新颖的转录因子B,非常想知道这个TF到底在调控哪个基因。 研究方法不过几种 ...

Wed Apr 18 01:57:00 CST 2018 0 2418
ceRNA 调控机制

ceRNA 不同于mRNA, lncRNA, ncRNA 等概念,其指的既不是某一种类型的RNA(比如mRNA, lncRNA), 也不是某一类的RNA(如ncRNA); ceRNA 其实指的是不同种类的RNA之间的调控机制,英文名为 competing endogenous RNA , 翻译成 ...

Tue May 02 18:12:00 CST 2017 0 1988
线性调整率(line regulation )和负载调整率(load regulation

本文转载CSDN,原文地址:http://blog.csdn.net/xiayufeng520/article/details/46293149 线性调整率 Line Regulation   定义: 又称源效应或电网调整率,是指输出电压随输入电压的线性变化的波动,条件是全满载。(输入电压 ...

Tue Dec 26 03:08:00 CST 2017 0 1802
什么是转录因子?

什么是转录因子? 转录因子 转录因子基本介绍 什么是转录因子? 转录因子(Transcriptionfactor,TF)是一个能与特异DNA序列结合的蛋白,可以单独或与其他蛋白形成复合体,提高或阻断特性基因对RNA聚合酶的招募,调控着基因的表达。转录 ...

Fri Oct 19 06:37:00 CST 2018 0 10052
转录与翻译

gene structure transcription 1.DNA上有转录启动位点和终止位点,RNA聚合酶结合到上面,得到RNA(primary transcript) 2.RNA被切掉内含子,加上5帽子和3尾巴,得到成熟mRNA(RNA-seq研究对象) 3.mRNA到核外,翻译成蛋白 ...

Tue Nov 20 18:11:00 CST 2018 0 697
 
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