原文:【豆科基因組】綠豆Mungbean, Vigna radiata蘇綠基因組預印

目錄 一 來源 二 結果 測序組裝 組裝評價 編碼基因預測 基因功能注釋 非編碼RNA注釋 假基因預測 重復序列注釋 進化分析和分歧時間估計 全基因組復制 LTR插入時間估計 正選擇基因 一 來源 High quality genome assembly, annotation and evolutionary analysis of the mungbean Vigna radiata gen ...

2021-06-16 18:04 0 173 推薦指數:

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豆科基因組綠豆Mungbean, Vigna radiata基因組2014NC

目錄 來源 一、簡介 二、結果 基因組組裝 重復序列和轉座子 基因組特征和基因注釋 綠豆的馴化 豆科基因組復制歷史 基於轉錄組分析的豇豆屬形成 綠豆育種基因組資源 三、討論 四、方法 ...

Tue Jun 15 20:59:00 CST 2021 0 212
基因組注釋

基因組注釋主要包括四個研究方向:重復序列的識別;非編碼RNA的預測;基因結構預測和基因功能注釋。我們將分別對這四個領域進行闡述。 1 重復序列的識別。 1.1 重復序列的研究背景和意義:重復序列可分為串聯重復序列(Tendam repeat)和散在重復序列 ...

Mon Jan 11 19:48:00 CST 2016 0 4001
參考基因組

參考基因組版本命名參考基因組聯盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等機構組成。GRC 利用最佳的技術裝配,糾正,增加基因組序列,以此作為在生信分析領域作為參考的基因組。人基因組官名叫 GRCh38 (Genome ...

Sat Jun 12 20:52:00 CST 2021 0 1267
動物基因組與植物基因組基本差異

植物vs動物總結版: 簡述高等植物基因組(可以以擬南芥和水稻基因組為例)與高等動物基因組(可以以人類、果蠅等基因組為例)在基因結構層面展示出來的基本差異。 高等植物基因組與高等動物基因組基因結構上的基本差異主要是生命學的第一困境,即復制-轉錄負載困境。 機制: 1.從平衡流 ...

Fri Dec 20 00:01:00 CST 2019 0 1047
NextDenovo 組裝基因組

NextDenovo 是有武漢未來組團隊開發出來用於組裝ONT,Pacbio, HIFI (默認參數可對60-100X數據更有效),可通過correct--assemble對其進行組裝。組裝后, ...

Fri Jan 22 22:52:00 CST 2021 0 456
 
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