原文:Multiple Testing | 多重假設檢驗 | FDR

RNA seq數據分析中,為了鑒定兩個group 差異表達的基因,會針對每一個基因分別做假設檢驗 例如T test ,這里會出來一個P value,但是往往R中專門做差異表達的package,還會有Adjusted P 這么一個P value。或者我們經常會碰到FDR這個概念。這些說的都是Multiple Testing。 . 首先當我們要針對多個特征 例如基因 做假設檢驗時,由於每次檢驗都有一定 ...

2020-07-25 17:59 0 1453 推薦指數:

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假設檢驗(Hypothesis Testing

什么是假設檢驗   假設檢驗是用來判斷樣本與樣本,樣本與總體的差異是由抽樣誤差引起還是本質差別造成的統計推斷方法。其基本原理是先對總體的特征作出某種假設,然后通過抽樣研究的統計推理,對此假設應該被拒絕還是接受作出推斷。   生物現象的個體差異是客觀存在,以致抽樣誤差不可避免,所以我 ...

Sat Sep 22 05:11:00 CST 2018 0 703
假設檢驗(Hypothesis Testing

假設檢驗的定義 假設檢驗:先對總體參數提出某種假設,然后利用樣本數據判斷假設是否成立。在邏輯上,假設檢驗采用了反證法,即先提出假設,再通過適當的統計學方法證明這個假設基本不可能是真的。(說“基本”是因為統計得出的結果來自於隨機樣本,結論不可能是絕對的,所以我們只能根據概率上的一些依據進行 ...

Wed Sep 11 02:20:00 CST 2019 0 3072
假設檢驗(Hypothesis Testing

假設檢驗(Hypothesis Testing) 1. 什么是假設檢驗呢?   假設檢驗又稱為統計假設檢驗,是數理統計中根據一定假設條件由樣本推斷總體的一種方法。   什么意思呢,舉個生活中的例子:買橘子(借用http://www.360doc.com/content/16/0617/08 ...

Sat Mar 31 19:32:00 CST 2018 0 1745
學習筆記50—多重假設檢驗與Bonferroni校正、FDR校正

總結起來就三句話: (1)當同一個數據集有n次(n>=2)假設檢驗時,要做多重假設檢驗校正 (2)對於Bonferroni校正,是將p-value的cutoff除以n做校正,這樣差異基因篩選的p-value cutoff就更小了,從而使得結果更加嚴謹 (3)FDR校正是對每個 ...

Wed Jan 09 01:49:00 CST 2019 0 689
(九)假設檢驗

學習假設檢驗的基礎知識,包括如何設置假設檢驗。 統計學家規定了關於可能性或不可能性的三個常規級別:如果達到樣本均值的概率小於,0.05 即 5%,0.01 即 1% 或 0.001 即 0.1%,那么通常被視為不太可能發生。概率小於 0.1% 的情況是非常不可能的,這些叫做 α 水平。 現在 ...

Wed Oct 11 22:52:00 CST 2017 1 10875
四、假設檢驗

1. 假設檢驗的基本概念   在總體的分布函數完全未知或只知其形式、 但不知其參數的情況下, 為了推斷總體的某些性質, 提出某些關於總體的假設。   假設檢驗就是根據樣本對所提出的假設作出判斷: 是接受, 還是拒絕。 基本原理   小概率推斷原理:小概率事件(概率接近0的事件 ...

Sun Dec 19 21:06:00 CST 2021 0 821
假設檢驗

假設檢驗是先對總體參數進行提出某種假設的前提下,利用樣本信息判斷假設是否成立。 假設檢驗中基本概念 原假設和備擇假設假設,用H0表示。原假設一般是統計者想要拒絕的假設。 備擇假設,用H1表示。備則假設是統計者想要接受的假設。 為什么統計者想要拒絕的假設設置為原假設呢?這是 ...

Fri May 15 23:43:00 CST 2020 0 599
 
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