bowtie和bowtie2使用條件區別及用法
轉載自：https://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一、轉錄組還是基因組？ map常用的工具有bowtie/bowtie2, BWA,SOAP1/SOAP2等。這個問題又會被分成兩個問題，是基因組測序 ...
原文：Bowtie使用介紹
Bowtie使用介紹 轉載自：http: bioinformation.cn p Bowtie 下載 是一個超級快速的，較為節省內存的短序列拼接至模板基因組的工具。它在拼接 鹼基長度的序列時，可以達到每小時 . 億次的拼接速度。Bowtie並不是一個簡單的拼接工具，它不同於Blast等。它適合的工作是將小序列比對至大基因組上去。它最長能讀取 個鹼基的片段。換言之，bowtie非常適合下一代測序技術 ...
2018-06-20 11:21 0 5207 推薦指數：
相關推薦
Bowtie2的安裝與使用
Bowtie2的安裝與使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用來快速比對短reads(50-100bp)與參考基因組，與常規的比對軟件不同的是（如blast），Bowtie在比對比較短的reads（less ...
比對程序 Bowtie2 的簡單使用
主要簡述 bowtie2 的入門用法，完成從原始序列到最后完成mapping 之后的 sam格式文件。 參考文檔 最重要的參考文檔還是官方文檔： Bowtie2-mannual Getting started with Bowtie 2 文獻: Fast ...
使用bowtie2 tophat2 及 cufflinks 處理RNA-SEQ數據
未經本人授權禁止轉載。 1 安裝bowtie2 ubuntu上用bin裝ok，suse上編譯裝的，中間包依賴有問題，可用zypper安裝所需包 2 安裝tophat2 ubuntu上用bin裝ok，suse上執行的時候報找不到samtools，但是官網上手冊說tophat2不需要 ...
bowtie2 Linux安裝
目前最新版本為2.3.2，網址為：https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.2 安裝分為簡單的下載可執行文件和源編譯安裝。 如上圖所示，bowtie2-2.3.2-source.zip為源代碼，需要用 ...
bowtie2-inspect 根據bowtie2的索引取得fasta 序列
/Human/hg19/bowtie2_db/hg19.fa.fa [2016-02-27 11:40: ...
生物信息bowtie比對軟件的結果格式說明
生物信息分析中會用到很多的比對軟件，比較常用的有bowtie、bowtie2、bwa等，比對文件的標准格式是sam格式，但是bowtie比對默認輸出的格式卻不是sam格式，由於bowtie適用於短序列比對，並且看突變鹼基比較方便，因此它的默認輸出格式還是有一定優勢的，下面就來說明一下 ...
bowtie:短序列比對的新工具
bowtie:短序列比對的新工具（轉） (2014-11-17 22:15:24) 轉載▼ 標簽： 轉載 原文地址： bowtie:短序列比對的新工具（轉 ...