iTOL基本用法已經會了，之前記錄過一點： 系統發育（進化）樹繪制小結。最近重用，調圖時又發現了些細節，記錄下備忘。
1. 注冊
不注冊也可用，但注冊登錄可保存樹在itol網站上。
2. 去枝長
進化樹能展示枝長是最好的，能用來判斷材料和群體間的特殊性。但現在大部分文章中的進化樹都是去掉了枝長的，也可以理解，樣本太多，展示不好看。
處理前：
處理后：
3. 加圖例
對進化樹添加分類后的注釋，圖片的圖例是需要自己設置的。不然就只能導出，用其他軟件添加，或用文字說明。
比如這里我注釋三圈，最內圈用range，外兩圈用strip（不懂的看之前文章或看itol示例注釋）。兩部分設置有點不同。
range的注釋圖例可點開legend即可。可以用鼠標自由移動圖例的相對距離。
strip的注釋圖例，需要自定義，如果有多重注釋，注意看選擇的是哪個數據集就對該數據集進行設置。最后同樣的，圖例位置可自由移動。
4. 無根樹顏色
材料過多時，我們常用無根樹來展示，這時一般展示枝長。很簡單，去標簽，注釋上色即可。
直接拖拽注釋文件上色。
但是由於樹枝太多密集，顏色顯示不是很明顯。需要做一點調整：將線型調小一點。
此外，還可以嘗試做一些高級調整，如去掉標尺、旋轉圖片角度等。
但因為無根樹去掉了標簽（樣本名稱），所以沒有range注釋，只有strip類型，需要手動設置圖例（見上）。或者不用圖例，直接在圖片備注中說明即可。
5. 導出圖片
當你要導出pdf、png等有長寬位置信息類型圖片時，最好選擇Full image，它會自動設置配置合適你的圖片大小。如果用screen，那么在網頁上是什么樣，導出就是什么樣，你不好把握尺寸。
另外，如果是png，分辨率也有必要設置一下，盡量大點。
