項目經理與職能經理有時候分不清他們具體的職責是什么，查找了一下，主要分如下幾塊：
1. 職責不同
項目經理對整個的項目負責。
職能經理對某部門負責
2. 權限不同
項目經理要比職能經理大的多。
3. 業績考核標准不同
項目經理的個人收益都是同項目盈虧直接掛鈎的。
職能經理的收益是與公司的整體收益掛鈎。
4. 工作方法不用
項目經理的職權在項目實施中有效，控制的職能較弱。
職能經理的職位相對穩定，職權的較長期性使得他們在管理上可以采用一些較強的手段。
5. 根據項目管理組織結構划分
簡單地說，在同時有項目和職能兩條線的公司基本都是矩陣型，權利大小而已。 項目權利大，那么職能部門相當於資源池，項目經理索取資源完成項目。
職能權利大一般是公司內部職能部門還有自己的工作，舉個例子比如可以外接項目的集團it部門，那么項目經理都是在職能經理管控之下，項目資源由職能經理分配。
根據公司組織架構類型划分 不同的類型決定了關系的不同，比如職能型的，職能經理就是項目經理的上級；項目型，項目經理就是職能經理的上級（少見）；混合型的，兩者同級。
項目經理的職權，因所在組織的結構不同而不同，權利小則僅僅充當項目干系人之間的溝通員，權利大則全權負責項目，甚至對項目的人事，資金等有絕對的話語權。