类似篇:转录因子motif TSS区域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一个新的领域,现在我关注的是可变剪切调控因子,如PTBP1,它们有特定的RNA结合motif,类似TF。 相同点: 都是蛋白质的序列结合区域 ...
什么是基因的可变剪切 有些基因的前体mRNA pre mRNA 通过不同的剪接方式 选择不同的剪接位点 产生不同的mRNA剪接异构体,这一过程称为可变剪接 或者选择性剪切 Alternative Splicing 。 常见的可变剪切可以分成 类: 外显子跳跃 Exon Skipping 内含子保留 Intron Retention 端可变剪接 Alternative splice Site 端可 ...
2015-12-27 11:04 0 12226 推荐指数:
类似篇:转录因子motif TSS区域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一个新的领域,现在我关注的是可变剪切调控因子,如PTBP1,它们有特定的RNA结合motif,类似TF。 相同点: 都是蛋白质的序列结合区域 ...
SUPPA是一款通过转录本定量来获取可变剪切定量结果的软件。转录本的定量方式有很多,例如count,FPKM, TPM等,作者建议使用TPM,因为先均一化了基因的长度,然后均一化了测序的深度。同时建议使用salmon软件进行定量 软件的下载与安装 首先下载salmon ...
suppa2继续测试,这个软件真的非常好用,速度很快、文档清晰、使用方便。 suppa核心文件: https://github.com/comprna/SUPPA ~/reference ...
可变剪切的预测已经很流行了,目前主要有两个流派: 用DNA序列以及variant来预测可变剪切;GeneSplicer、MaxEntScan、dbscSNV、S-CAP、MMSplice、clinVar、spliceAI 用RNA来预测可变剪切;MISO、rMATS、DARTS ...
前言:我们知道String类的修饰符是final,其char[] value也是由final修饰的,每次给String变量赋一个新值,都会创建一个新的String对象,很多有涉及到字符串本身的改变都是伴有(new String)的字样,所以我们说String类是不可变类。但StringBuffer ...
可变与不可变类型 1、可变与不可变类型 1)学python,一定要记住“一切皆为对象,一切皆为对象的引用”; 2)所谓可变对象是指,对象的内容可变,而不可变对象是指对象内容不可变 ...
如何剪切视频呢?剪切视频的方法有很多种,别急,今天小编给大家整理了使用VideoProc for Mac全能影片处理工具对视频进行剪切的教程,感兴趣的朋友快来跟小编看看吧! 使用VideoProc for Mac全能影片处理工具对视频进行剪切的教程: 1.打开 VideoProc 并单击 ...
做RNA-seq的数据分析,一直弄不清楚实验过程,最近有时间就找一些资料来了解一下,同时将整理的资料记录下来,方便以后查找。 来源资料:【3D演示】基因的表达(原版+字幕版) 人体从食物中获取营养的过程也就是化学消化过程,是通过酶对食物进行分解来得到营养物质。DNA用来制造酶和各种蛋白质。DNA ...