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GSEA-基因集富集分析

1.為什么寫? 網上教程一抓一大把,有的能重復,有的不能重復不了,很多原因。別人能做的不代表你能復制,實踐出真知。 不做搬運工,只寫有用的,防止以后忘記。每個人理解不同,記錄下來,供自己今后參考, ...

Thu Aug 30 01:40:00 CST 2018 0 19018
富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO

前言 一般我們挑出一堆感興趣的基因想臨時看看它們的功能,需要做個富集分析。雖然公司買了最新版的數據庫,如KEGG,但在集群跑下來嫌麻煩。這時網頁在線或者本地化工具派上用場了。 DAVID DAV ...

Tue May 28 19:20:00 CST 2019 0 7380
參考基因組及注釋文件下載

從三大核酸數據庫NCBI、Ensembl、UCSC 下載參考序列及注釋文件 0.人類基因組版本對應關系 NCBI Ensembl UCSC ...

Fri Sep 21 00:44:00 CST 2018 0 11029
MetaboAnalyst的多組學分析

MetaboAnalyst是做代謝的R包,功能十分強大。也開發了web版本,代謝組學的分析這里不介紹,主要講講它開發的多組學分析的相關內容。 既然是做代謝的工具,即使是增加了多組學內容,肯定也是以代 ...

Fri Nov 22 17:56:00 CST 2019 0 2491
蛋白質組學數據分析筆記匯總

前言 之前本來打算根據自己對蛋白質組學數據分析的經驗和理解寫一系列相關教程出來供復習參考,沒想到在網上查到別人已經做過了,而且筆記相當全面,從樣本處理到質譜儀原理再到數據分析等等都有提及,雖然是20 ...

Thu Nov 07 07:24:00 CST 2019 0 2351
多組學講座匯總

整理了一下以質譜技術為核心的多組學方面的講座,主要是中科新生命的,感覺質量還可以,適合入門觀看。是直播課,首次應該需要填寫資料才能進入直播間。 生命表型體現者,從“代謝到脂質到修飾”組學專場 ...

Sun Nov 10 06:57:00 CST 2019 0 316

 
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