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蛋白質組學數據分析——(1)原理

當前,關於高通量蛋白質組學的研究遠不如NGS這般火熱,網上關於這方面的知識也寥寥無幾,從事這一行也有一段時間了,但還沒好好總結過。加之過段時間可能要去做培訓,所以是時候把知識點總結一下,權當復習。當然 ...

Thu Jul 18 06:59:00 CST 2019 1 9679
富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO

前言 一般我們挑出一堆感興趣的基因想臨時看看它們的功能,需要做個富集分析。雖然公司買了最新版的數據庫,如KEGG,但在集群跑下來嫌麻煩。這時網頁在線或者本地化工具派上用場了。 DAVID DAV ...

Tue May 28 19:20:00 CST 2019 0 7380
蛋白質組學數據分析筆記匯總

前言 之前本來打算根據自己對蛋白質組學數據分析的經驗和理解寫一系列相關教程出來供復習參考,沒想到在網上查到別人已經做過了,而且筆記相當全面,從樣本處理到質譜儀原理再到數據分析等等都有提及,雖然是20 ...

Thu Nov 07 07:24:00 CST 2019 0 2351
質譜和蛋白質組學領域簡述

從事基於質譜的蛋白質組學信息分析也有一年多時間了,回過頭來還是需要縷一縷這個領域的方方面面,溫故知新。 簡要概述 蛋白質組學(Proteomics)是研究一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質的統 ...

Mon Jun 24 03:21:00 CST 2019 0 2200
質譜行業介紹

一、質譜儀 1. 質譜與質譜儀 質譜儀是一類物質分析儀器,它將分析樣品轉化成帶電離子並根據質荷比實現分離,檢測質荷比相對強度后生成質譜圖進行分析。 由於檢測質荷比的特性,質譜儀可以確定化合物的質 ...

Tue Jun 18 05:03:00 CST 2019 0 2026
比對軟件Blast,Blast+,Diamond比較

1. Blast (1)格式化數據庫 formatdb -i db.seq -p T -o T -l logfile 主要參數: -i 輸入需要格式化的源數據庫名稱 -p 文件類型,是核苷 ...

Thu Feb 28 06:15:00 CST 2019 0 2266

 
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