原文:文獻(4): Nature子刊_晚期非小細胞肺癌的單細胞圖譜

今天介紹的這一篇文獻 Ref ,發表在NC上,中規中矩,分析內容很全面也很常見 話說,NC上面好多這種描述性的單細胞文章 。 下面我會簡單介紹一下文獻內容,涉及到以下內容,大家可能會感興趣: 這篇文章是如何鑒定腫瘤細胞的 我之前專門寫過一篇推文講這個 腫瘤細胞和非腫瘤細胞一起降維聚類時,需不需要去批次 腫瘤細胞的異質性可以從哪幾個角度說明 腫瘤細胞的擬時序 軌跡分析怎么做 monocle 的經典 ...

2021-05-29 11:35 0 228 推薦指數:

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單細胞測序學習(一)

一、單細胞測序簡介   單細胞測序技術(single cell sequencing)是指在單個細胞水平上,對基因組、轉錄組、表觀組進行高通量測序分析的一項新技術,它能夠彌補傳統高通量測序的局限性,揭示單個細胞的基因結構和基因表達狀態,反映細胞間的異質性。   我們經常看到的scRNA-seq ...

Thu Oct 29 17:13:00 CST 2020 0 658
單細胞測序學習(二)

三、單細胞測序原理   今天主要介紹單細胞測序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前單細胞測序的兩大主流平台,所以今天的單細胞測序原理介紹也是基於這兩個平台的。  (1)10X Genomics單細胞測序原理         上圖是10X單細胞測序的原理圖。首先要 ...

Thu Oct 29 17:19:00 CST 2020 0 1281
單細胞測序的知識

單細胞測序的知識 劉小澤 已關注 2018.07.20 21:33* 字數 1885 閱讀 675評論 0喜歡 7 劉小澤寫於18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...

Sat Oct 20 04:02:00 CST 2018 0 1917
單細胞分析實錄(16): 負矩陣分解(NMF)檢測細胞異質性

相信做過腫瘤單細胞的小伙伴對這個分析並不陌生,如果多讀幾篇文獻,就能在CNS以及大子上面看到這個分析。 負矩陣分解(Nonnegative Matrix Factorization,NMF)是在矩陣中所有元素均為負數約束條件之下的矩陣分解方法。 基本思想:給定一個負矩陣V, NMF ...

Sat Jun 26 04:14:00 CST 2021 0 216
單細胞中的細胞類型划分

cell type classify .caret,.dropup>.btn>.caret{border-top-color:#000!important}.label{border:1px sol ...

Fri Mar 15 04:13:00 CST 2019 0 814
Seurat | 單細胞分析工具

Seurat是一個老牌的單細胞分析工具了(satija的力作),我之前測試過,但是沒怎么用。 最近發現這個工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下這篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...

Mon Jun 04 19:09:00 CST 2018 0 2724
 
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