SUPPA 可變剪切分析
SUPPA是一款通過轉錄本定量來獲取可變剪切定量結果的軟件。轉錄本的定量方式有很多，例如count，FPKM, TPM等，作者建議使用TPM，因為先均一化了基因的長度，然后均一化了測序的深度。同時建議使用salmon軟件進行定量 軟件的下載與安裝 首先下載salmon ...
原文：可變剪切 | isoform | PSI | 單細胞 | suppa
suppa 繼續測試，這個軟件真的非常好用，速度很快 文檔清晰 使用方便。 suppa核心文件: https: github.com comprna SUPPA references SUPPA ref hg Homo sapiens.GRCh . .formatted.gtf ensembl hg .events.ioe 分析步驟小結： 用salmon快速比對，reference是轉錄本fast ...
2021-03-01 02:10 0 567 推薦指數：
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