三、單細胞測序原理 今天主要介紹單細胞測序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前單細胞測序的兩大主流平台,所以今天的單細胞測序原理介紹也是基於這兩個平台的。 (1)10X Genomics單細胞測序原理 上圖是10X單細胞測序的原理圖。首先要 ...
一 單細胞測序簡介 單細胞測序技術 single cell sequencing 是指在單個細胞水平上,對基因組 轉錄組 表觀組進行高通量測序分析的一項新技術,它能夠彌補傳統高通量測序的局限性,揭示單個細胞的基因結構和基因表達狀態,反映細胞間的異質性。 我們經常看到的scRNA seq其實就是single cell RNA seq的縮寫,即單細胞RNA測序,或叫單細胞轉錄組測序。 上圖為單細胞發展 ...
2020-10-29 09:13 0 658 推薦指數:
三、單細胞測序原理 今天主要介紹單細胞測序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前單細胞測序的兩大主流平台,所以今天的單細胞測序原理介紹也是基於這兩個平台的。 (1)10X Genomics單細胞測序原理 上圖是10X單細胞測序的原理圖。首先要 ...
單細胞測序的知識 劉小澤 已關注 2018.07.20 21:33* 字數 1885 閱讀 675評論 0喜歡 7 劉小澤寫於18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...
單細胞測序技術是指在單個細胞水平上對轉錄組或基因組進行擴增並測序,以檢測單細胞在基因組(結構變異-Structural Variations-SVs;拷貝數變異-Copy number variants-CNVs;單核苷酸變異-Single nucleotide variants-SNVs ...
在有些情況下,細胞是很難完整分離的,比如長期保存的組織,或者大腦細胞和脂肪細胞。在分離細胞時所用的酶和破壞力往往會影響其他細胞區室的內容。此時,單核RNA測序就顯得特別重要。 細胞核轉錄組是否代表了整個細胞的轉錄組,以及在snRNA-seq中發現的基因是否或多或少與特定研究相關。一些比較單細胞 ...
單細胞轉錄組 從研究方向看上,發育生物學、免疫、神經生物學、腫瘤是排名靠前的方向,這和我們平時遇到的高頻研究方向基本吻合。另外,作為一個新興的領域,10X 單細胞轉錄組檢測到細胞多,數據龐大,信息復雜,對數據分析帶來諸多困難,因此算法類的文章(Computational method ...
單細胞測序 Trajectory analysis 軌跡推斷細胞多樣性不能通過離散的分類系統(例如細胞聚類)充分描述。觀察到的細胞異質性發展的生物進程是一個連續過程(Tanay&Regev,2017)。因此,為了捕獲細胞身份之間的過渡狀態、不同的分化分支或生物學功能的漸進式非同步變化,我們需要動態 ...
單細胞RNA測序技術之入門指南 【字體: 大 中 小 】 時間:2018年09月12日 來源:生物通 編輯推薦: 在這個飛速發展的測序時代,DNA和RNA測序已經逐漸成為“實驗室中的家常菜”。若要評選出目前最受歡迎的一道菜,那恐怕非單細胞RNA測序莫屬 ...
單細胞測序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity:the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between ...