原文:轉錄組數據分析思路

轉錄組緊緊圍繞基因表達量和功能分析兩部分,結合生物學問題來進行數據分析。 高表達基因已經研究比較透徹,應該更多關注中低表達基因。 層次聚類的妙用: 全部基因 gt 差異分析 gt 根據趨勢挑選部分特異性基因 gt 功能分析 功能大類聚類 gt 根據趨勢挑選部分特異性功能 gt 功能小類聚類 通路表達量的計算:該通路全部基因表達量之和除以該通路基因數 趨勢分析 cmeans聚類 闡釋不了太多生物學問 ...

2020-07-19 11:45 0 2013 推薦指數:

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單細胞轉錄測序技術及各類數據分析方法總結

自從2009年單細胞轉錄測序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技術首次問世,至今已經有幾十種不同的scRNA-seq技術相繼被開發出來。在過去的十年里,單細胞轉錄測序技術得到了蓬勃的發展,從而使得可在單細胞水平揭示全基因范圍內所有基因的表達情況,可以更精准的開展 ...

Tue Sep 17 20:35:00 CST 2019 0 1696
蛋白質數據分析——(1)原理

當前,關於高通量蛋白質學的研究遠不如NGS這般火熱,網上關於這方面的知識也寥寥無幾,從事這一行也有一段時間了,但還沒好好總結過。加之過段時間可能要去做培訓,所以是時候把知識點總結一下,權當復習。當然整個蛋白質學研究也算紛繁復雜,不可能面面俱到,而且很多東西我也在學習當中,肯定會出現不少紕漏 ...

Thu Jul 18 06:59:00 CST 2019 1 9679
【代謝學】3.數據分析

目錄 非靶向代謝實驗設計 數據分析流程 1.數據預處理 2.數據質控 3.統計分析 非靶向代謝實驗設計 1.代謝物提取,一般要求每組至少10個樣; 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC; 3.QC樣本與實驗 ...

Wed Dec 30 19:49:00 CST 2020 0 1297
【代謝學】3.數據分析

非靶向代謝實驗設計 1.代謝物提取,一般要求每組至少10個樣; 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC; 3.QC樣本與實驗樣本穿插上機,開始十個QC,結尾三個QC,中間每十個樣本穿插一個QC樣本 。 得到質譜譜圖數據經軟件處理后得到峰表。 峰表格式一般為:每行為一個m/z,每列為一個樣 ...

Mon Dec 30 06:35:00 CST 2019 0 5963
【3】腫瘤基因數據分析方法概述

目錄 腫瘤基因組分析 腫瘤標准分析 高級分析 腫瘤數據庫 腫瘤基因組分析 腫瘤進化過程 基本概念:germline/somatic/driver/passenger mutation 二次打擊學說:生殖突變+體細胞突變 主要 ...

Tue Aug 25 17:46:00 CST 2020 0 948
數據分析

數據分析的概念 什么是數據分析   就是從現有的數據中挖掘出價值 數據分析應用領域   商品推薦     eg:在淘寶上搜索了一款產品之后,接下來就會瘋狂給你推薦相關產品   量化交易     股票,期貨等數據分析   短視頻推送     抖音,今日頭條等短視頻 (數據分析 ...

Wed Oct 13 03:54:00 CST 2021 0 92
 
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