原文:人類基因組概況--整理

人類基因組概況: 人類基因組由ATCG四種鹼基組成,但是CG的含量低於 ,所以CG含量低於AT含量。 一個基因組的dna大約 ug。 snp: 平均每 到 個鹼基會出現 個SNPs,不過密度並不均勻。 如果按照每 個鹼基存在 個SNP來計算,人類 億個鹼基中,大約有 萬個SNPs。 人類基因組的突變頻率 的 次方。即:每 的 次方個鹼基,就會發生一個突變。 基因組長度: 人類基因組有 億個鹼基 的 ...

2020-03-26 07:18 0 1514 推薦指數:

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用Annovar注釋非人類基因組,如小鼠mm9

annovar一般只包含人類基因組注釋數據庫,其他的物種如小鼠需要自己進行建立注釋信息。 第一步:下載annovar軟件上Annovar官網下載(http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/),現在要郵件 ...

Tue Jul 04 05:19:00 CST 2017 0 1576
HGNC 數據庫-人類基因組數據庫

HGNC 全稱為HUGO Gene Nomenclature Committee, 叫做 HUGO基因命名委員會,負責對人類基因組上包括蛋白編碼基因, ncRNA基因,甲基因和其他基因在內的所有基因提供一個唯一的,標准的,可以廣泛傳播的symbol; 數據庫的主頁為 http ...

Mon May 15 18:39:00 CST 2017 0 7893
人類線粒體基因組簡介

線粒體基因組是一個環狀的雙鏈DNA分子,包括輕鏈 L 和 重鏈 H, 其基因結構在哺乳動物中保守, 以human 線粒體為例, 人類線粒體基因組全長 16,596 bp , 共有13個編碼蛋白的基因,根據編碼的蛋白可以分成3類: 共有22種tRNA的基因 2種 ...

Wed Jun 28 01:39:00 CST 2017 0 8083
基因組注釋

基因組注釋主要包括四個研究方向:重復序列的識別;非編碼RNA的預測;基因結構預測和基因功能注釋。我們將分別對這四個領域進行闡述。 1 重復序列的識別。 1.1 重復序列的研究背景和意義:重復序列可分為串聯重復序列(Tendam repeat)和散在重復序列 ...

Mon Jan 11 19:48:00 CST 2016 0 4001
參考基因組

參考基因組版本命名參考基因組聯盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等機構組成。GRC 利用最佳的技術裝配,糾正,增加基因組序列,以此作為在生信分析領域作為參考的基因組。人基因組官名叫 GRCh38 (Genome ...

Sat Jun 12 20:52:00 CST 2021 0 1267
動物基因組與植物基因組基本差異

植物vs動物總結版: 簡述高等植物基因組(可以以擬南芥和水稻基因組為例)與高等動物基因組(可以以人類、果蠅等基因組為例)在基因結構層面展示出來的基本差異。 高等植物基因組與高等動物基因組基因結構上的基本差異主要是生命學的第一困境,即復制-轉錄負載困境。 機制: 1.從平衡流 ...

Fri Dec 20 00:01:00 CST 2019 0 1047
NextDenovo 組裝基因組

NextDenovo 是有武漢未來組團隊開發出來用於組裝ONT,Pacbio, HIFI (默認參數可對60-100X數據更有效),可通過correct--assemble對其進行組裝。組裝后, ...

Fri Jan 22 22:52:00 CST 2021 0 456
 
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