線粒體基因組是一個環狀的雙鏈DNA分子，包括輕鏈 L 和 重鏈 H, 其基因結構在哺乳動物中保守，
以human 線粒體為例，
人類線粒體基因組全長 16,596 bp ,
共有13個編碼蛋白的基因，根據編碼的蛋白可以分成3類：
共有22種tRNA的基因
2種 rRNA 基因：
在人類的線粒體基因組中，輕鏈共有9個基因，其中8個基因都是編碼tRNA; 重鏈共有28個基因
除了基因區域外，在線粒體基因組中，還有一個調控區域，叫做D-loop 區
在線粒體基因組中，基因排列十分緊密，基因間隔區只有87bp, 占線粒體總長的0.5%；
會出現重疊基因的現象，比如ND4 和 ND4L的基因就出現了重疊；
除了重疊基因外，基因還會出現多拷貝的現象，比如 絲氨酸有對應的 TRNS1 和 TRNS2 兩個拷貝
線粒體基因的遺傳密碼表和通過的遺傳密碼表有一定的差異:
參考資料：
https://en.wikipedia.org/wiki/Human_mitochondrial_genetics
http://baike.baidu.com/item/%E7%BA%BF%E7%B2%92%E4%BD%93/376884