人類基因組概況: 人類基因組由ATCG四種鹼基組成,但是CG的含量低於50%,所以CG含量低於AT含量。 一個基因組的dna大約3ug。 snp: 平均每100到1000個鹼基會出現1個SNPs,不過密度並不 ...
線粒體基因組是一個環狀的雙鏈DNA分子,包括輕鏈 L 和 重鏈 H, 其基因結構在哺乳動物中保守, 以human 線粒體為例, 人類線粒體基因組全長 , bp , 共有 個編碼蛋白的基因,根據編碼的蛋白可以分成 類: 共有 種tRNA的基因 種 rRNA 基因: 在人類的線粒體基因組中,輕鏈共有 個基因,其中 個基因都是編碼tRNA 重鏈共有 個基因 除了基因區域外,在線粒體基因組中,還有一個調控 ...
2017-06-27 17:39 0 8083 推薦指數:
人類基因組概況: 人類基因組由ATCG四種鹼基組成,但是CG的含量低於50%,所以CG含量低於AT含量。 一個基因組的dna大約3ug。 snp: 平均每100到1000個鹼基會出現1個SNPs,不過密度並不 ...
的關系,以人類基因組為例: 在NCBI中,對於不同的拼裝版本,以NCBI Build Number ...
基因組注釋主要包括四個研究方向:重復序列的識別;非編碼RNA的預測;基因結構預測和基因功能注釋。我們將分別對這四個領域進行闡述。 1 重復序列的識別。 1.1 重復序列的研究背景和意義:重復序列可分為串聯重復序列(Tendam repeat)和散在重復序列 ...
參考基因組版本命名參考基因組聯盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等機構組成。GRC 利用最佳的技術裝配,糾正,增加基因組序列,以此作為在生信分析領域作為參考的基因組。人基因組官名叫 GRCh38 (Genome ...
全基因組選擇(Genomic selection, GS)是一種利用覆蓋全基因組的高密度標記進行選擇育種的新方法,可通過早期選擇縮短世代間隔,提高育種值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估計准確性等加快遺傳進展,尤其對低遺傳力、難測定的復雜性狀具有較好 ...
annovar一般只包含人類基因組注釋數據庫,其他的物種如小鼠需要自己進行建立注釋信息。 第一步:下載annovar軟件上Annovar官網下載(http://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/),現在要郵件 ...
HGNC 全稱為HUGO Gene Nomenclature Committee, 叫做 HUGO基因命名委員會,負責對人類基因組上包括蛋白編碼基因, ncRNA基因,甲基因和其他基因在內的所有基因提供一個唯一的,標准的,可以廣泛傳播的symbol; 數據庫的主頁為 http ...
考慮到cnblog不適合基因組領域這種類型的文章, 最終,我自己開通了公眾號:鹼基礦工,歡迎感興趣的同學關注! 也可以關注我的知乎:https://www.zhihu.com/people/yellowtree/activities 2018年1月修改:這篇文章寫於2013年,首發 ...