原文:ERCC spike-in RNA的調研

ERCC的調研 在RNA seq數據分析中,為了比較不同樣本 不同基因之間的表達差異,通常會對數據進行標准化轉化,得到RPKM FPKM TPM等指標。但是這些指標都是相對定量,相對定量有兩個前提: 是絕大多數的gene表達量不變 是高表達量的gene表達量不發生改變。 可是在一些比較特殊的樣本體系下,這兩個基本假設有可能不能同時符合。比如針對很多癌症樣本,經常會出現一些很重要的高表達gene發生 ...

2020-02-25 17:45 0 2900 推薦指數:

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RNA velocity | RNA速率

單細胞轉錄組確實是利器,但我們大多只利用了表達的信息,而從reads到表達之間的信息完全被我們忽略了。 最近nature發了一篇單細胞方法類文章,講得就是如何利用RNA velocity來做細胞發育路徑的推斷。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...

Mon Aug 20 20:19:00 CST 2018 0 2390
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing)

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...

Fri Oct 19 05:42:00 CST 2018 0 2871
初探RNA | RNA分類 | miRNA | lncRNA

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Wed Dec 15 21:49:00 CST 2021 0 813
RNA velocity | RNA速率 | velocyto教程

一個比原版更好用的RNA velocity分析工具:velocyto GitHub:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R readthedoc:http://velocyto.org/velocyto.py/index.html 歷史 ...

Wed Jan 13 00:57:00 CST 2021 0 1659
單細胞測序 RNA velocity | RNA速率

單細胞測序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity:the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between ...

Sun Jun 27 18:21:00 CST 2021 0 210
SLAYER: Spike Layer Error Reassignment in Time

鄭重聲明:原文參見標題,如有侵權,請聯系作者,將會撤銷發布! 32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NeurI ...

Tue Jan 19 17:25:00 CST 2021 0 633
jmeter模擬spike測試(尖峰測試)

概述 尖峰測試(Spike testing)在性能測試中屬於壓力測試的一個子集。指的是在某一瞬間或者多個頻次下用戶數和壓力陡然增加的場景。 為了驗證我們的網站在訪問用戶急劇增加的情況下,或者短時間內反復急劇增加工作負載時能否正常工作;以及程序能否從高負荷中恢復並正常工作時常常用到這種測試 ...

Sun Jun 30 19:03:00 CST 2019 3 835
 
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