barcode),借此可以分辨出哪些是參照物序列,哪些是待檢品序列。 An RNA spike-in ...
ERCC的調研 在RNA seq數據分析中,為了比較不同樣本 不同基因之間的表達差異,通常會對數據進行標准化轉化,得到RPKM FPKM TPM等指標。但是這些指標都是相對定量,相對定量有兩個前提: 是絕大多數的gene表達量不變 是高表達量的gene表達量不發生改變。 可是在一些比較特殊的樣本體系下,這兩個基本假設有可能不能同時符合。比如針對很多癌症樣本,經常會出現一些很重要的高表達gene發生 ...
2020-02-25 17:45 0 2900 推薦指數:
barcode),借此可以分辨出哪些是參照物序列,哪些是待檢品序列。 An RNA spike-in ...
單細胞轉錄組確實是利器,但我們大多只利用了表達的信息,而從reads到表達之間的信息完全被我們忽略了。 最近nature發了一篇單細胞方法類文章,講得就是如何利用RNA velocity來做細胞發育路徑的推斷。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...
基本問題: RNA的起源、定位和意義 明確RNA的各種概念分類 各種RNA的基本結構和功能 意義 有一種學說:RNA是生命的起源。 先有雞(DNA)還是先有蛋(蛋白質),好像都不太可能,那有沒有可能先有RNA?橋接了DNA和蛋白質,RNA本身也是一種酶 ...
一個比原版更好用的RNA velocity分析工具:velocyto GitHub:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R readthedoc:http://velocyto.org/velocyto.py/index.html 歷史 ...
單細胞測序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity:the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between ...
鄭重聲明:原文參見標題,如有侵權,請聯系作者,將會撤銷發布! 32nd Conference on Neural Information Processing Systems (NeurI ...
概述 尖峰測試(Spike testing)在性能測試中屬於壓力測試的一個子集。指的是在某一瞬間或者多個頻次下用戶數和壓力陡然增加的場景。 為了驗證我們的網站在訪問用戶急劇增加的情況下,或者短時間內反復急劇增加工作負載時能否正常工作;以及程序能否從高負荷中恢復並正常工作時常常用到這種測試 ...