原文:基因名稱轉換問題

轉自歐意生物。https: www.sohu.com a LncRNA自從發現至今,相關研究如火如荼。歐易生物也給很多科研工作者提供lncRNA測序和芯片檢測的服務工作。但檢測后,很多老師反饋,lncRNA序列等相關信息查詢非常困難,憶秋就此整理一套lncRNA常用 好用的數據庫,供各位看官參考。 .LNCipedia 該數據庫針對人進行lncRNA數據的收集 整理,共收入 , 條人類有注釋的ln ...

2019-07-31 22:32 0 535 推薦指數:

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基因id轉換

DAVID網站提供了id轉換的功能 1 選擇上傳gene list文件 2 選擇上傳ID的類型,我們ID-list.txt中的是Ensembl Gene ID,所以這里選ENSEMBL_GENE_ID 3 這個是類型,因為只做ID轉換,所以選Gene ...

Thu May 09 15:48:00 CST 2019 0 2332
bioMart進行基因id的轉換

1.bioMart包的介紹 bioMart包是一個連接bioMart數據庫的R語言接口,能通過這個軟件包自由連接到bioMart數據庫,這個包可以做以下幾個工作: 1.查找某個基因在染色體上的位置。反之,給定染色體每一區間,返回該區間的基因; 2.通過EntrezGene的ID ...

Tue Dec 17 23:40:00 CST 2019 0 9191
使用"biomaRt"包進行基因ID轉換

1、安裝"biomaRt"包 2、"ensembl_transcript_id_version" 轉 "refseq_mrna", "ensembl_gene_id", "hgnc_symbol" 輸入文件file.txt如下所示: 轉換命令如下: 輸出文件new如下所示: ...

Tue Jul 27 19:15:00 CST 2021 0 184
liftover-基因坐標的轉換

liftover的介紹 人類基因組有不同的版本,目前用的最多的是hg38和hg19,為了將不同版本的染色體上的位置一一對應,UCSC出了這款工具liftOver,官方的定義是: This tool converts genome coordinates and genome ...

Wed Dec 11 05:51:00 CST 2019 0 361
vue的組件名稱問題

如果組件名稱中帶有大寫字母,那么會報錯 ...

Thu May 16 09:06:00 CST 2019 0 572
Windows按名稱排序問題

偶然發現一個按名稱排序的文件夾內,文件順序是混亂的,例如: 在一個文件夾內建立如下三個文件: 0F.txt 1A.txt 02.txt 按名稱/升序排列, 將得到上述結果,0F在最前,02在最后。 百思不得其解,同樣是0開頭,為什么02會被排在1A之后? Win7,Win8 ...

Mon Sep 02 22:08:00 CST 2013 0 2697
基因組注釋】GMAP安裝使用問題

homology策略預測基因結構,下載了公共mRNA/CDS序列,考慮用gmap比對。本來是個很簡單的腳本,但總是不那么順利。 無論是用conda安裝,還是源碼安裝較新版本,都存在問題。 第一步建立索引都沒問題。但比對時,沒報錯,出現如下: 結果是cds_gene.gff3除了表頭 ...

Fri Apr 16 06:43:00 CST 2021 0 336
 
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