用blast blastn進行短序列的搜索（比對）
blastn 多加上 -task blastn-short -word_size 7 -evalue 1 -task：設置比對模式，通常情況會有一個默認task，這里要設置為blastn-short -word_size：盡可能小，這里設為7 -evalue：類似於p值的一個指標，越小說明越 ...
原文：bowtie:短序列比對的新工具
bowtie:短序列比對的新工具 轉 : : 轉載 標簽： 轉載 原文地址： bowtie:短序列比對的新工具 轉 作者： 玉琪星兆 Bowtie是一個超級快速的，較為節省內存的短序列拼接至模板基因組的工具。它在拼接 鹼基長度的序列時，可以達到每小時 . 億次的拼接速度。 Bowtie並不是一個簡單的拼接工具，它不同於Blast等。它適合的工作是將小序列比對至大基因組上去。它最長能讀取 個鹼基的 ...
2018-11-09 22:51 0 813 推薦指數：
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